当前位置：网站首页 » 观点 » 内容详情

kegg通路权威发布_kegg通路图怎么看(2024年12月精准访谈)

内容来源：牛排名所属栏目：观点更新日期：2024-11-30

kegg通路

网络药理学学习资料大放送，轻松掌握！ 𐟎“ 曾经花费5000元购买的网络药理学资料，现在免费分享给大家！这些资料对我帮助巨大，现在用不到了，希望对你们也有帮助。 𐟓š 网络药理学其实并不复杂，三天就能入门。以下是部分资料内容：网络药理学做图软件（3个）网络药理学相关文献网络药理学系列一（共11讲）网络药理学系列二（共14讲）网络药理学系列三（共15讲） 𐟒Š 特别推荐：TCMSP中药网络药理学资料，包括14个视频，涵盖KEGG通路富集分析、GO功能富集分析、symbol转换为基因id、PPI网络核心基因、PPI网络构建以及中药网络药理学可视化等多个方面。 𐟓‚ 这些资料不仅适合初学者，也适合有一定基础的药理学家。快来下载，开启你的网络药理学之旅吧！

花一天搞懂KEGG信号通路，值得吗？信号通路，也叫作KEGG通路，是分子机制的核心。它的魅力在于，只需一人之力就能揭开整个分子世界的奥秘。通路的本质在于分子变量，由一组已知的、且确定上下游信号传导关系的明星分子组成。每个通路都有代表性的标志物（Biomarkers），只要搞清楚这些标志物，就能窥见整个通路的奥秘。目前，科研中最热门的9种信号通路分别是：NF-、PI3K/AKT、MAPK、JAK-STAT、TGF-€Wnt、Notch、Hedgehog和Hippo通路。在学习这些通路时，不需要深入挖掘各种细节，只需把握通路中最关键的几个标志物即可。跨越通路学习的初级阶段时，无需深挖各种细节，只需把握路通中最关键的几个biomarker即可。

网络药理学：从零开始到发表SCI的指南网络药理学其实并没有大家想象的那么高深莫测。今天，我就来分享一些我自己学习网络药理学时用到的各种资料，希望能帮到大家。网络药理学的基础概念 𐟌 网络药理学是基于药物与药物之间在结构、功效等方面的相似性，以及机体内靶标分子和生物效应分子的多种相互作用关系，通过构建药物-药物、药物-靶标等网络来预测药物的功效以及特定功效对应的药物。简单来说，就是通过分析药物之间的相互作用关系来理解药物的疗效。中药网络药理学的分析思路 𐟌🊊中药网络药理学主要基于中药复方，利用系统生物学与系统药理学的原理，研究中药的多成分、多靶点特点。分析思路通常分为三步：第一步：找到有效靶点。通过数据库、文本挖掘或软件预测等手段找到某方剂、药对或中药中的有效靶点。这一步的加分项是通过计算机模拟和体外实验（如SPR分析、Biocore）等验证药物小分子与靶分子之间的作用位点。第二步：筛选靶分子相关的生物学功能和分子通路。通过GO/KEGG富集分析来筛选靶分子相关的生物学功能和分子通路。第三步：构建互作网络。可以是药物-活性成分-相关生物学功能/通路之间的互作网络，也可以是活性成分-相关生物学功能/通路-表型/疾病之间的互作网络，甚至是靶分子之间的互作网络。这一过程中的每一步的预测，也可以根据预测网站或软件等分析工具加上对应的统计值表格。干湿结合的中药网络药理学研究 𐟒簟”劊这类研究侧重于实验研究，一般IF在3-5分之间。把网络药理学当作筛选靶基因、相关生物学功能、通路的预测手段，也是按三步走的策略，每一步再通过常规的分子生物学、细胞生物学的技术加以验证。网络药理学与生信结合的分析套路 𐟓Š𐟌 这类研究把生信分析套路和网络药理学套路有机结合，一般IF在1-6分左右。第一步是通过数据库、文本挖掘或软件预测等手段找到某方剂、药对或中药中的有效靶点。这一步的加分项是通过计算机模拟和体外实验（如SPR分析、Biocore）等验证药物小分子与靶分子之间的作用位点。网络药理学做图软件 𐟖寸常用的网络药理学做图软件有三个，分别是Cytoscape、Gephi和VisANT。这些软件可以帮助你更好地理解和可视化药物之间的相互作用关系。网络药理学相关文献 𐟓– 网络上有很多关于网络药理学的文献，可以通过数据库或学术期刊网站进行搜索和下载。这些文献可以为你提供更多的研究思路和方法参考。 TCMSP中药网络药理学资料 𐟌🊊TCMSP（中药系统药理学数据库）提供了大量的中药网络药理学资料，包括KEGG通路富集分析、GO功能富集分析等视频教程和脚本文件。这些资料可以帮助你更好地理解和应用中药网络药理学。总结 𐟓 网络药理学并不是高不可攀的学问，只要掌握了基本的概念和分析思路，再加上一些实用的工具和资料，你也能轻松上手。希望这篇指南能帮到你，祝你早日在SCI上发表自己的研究成果！

生信小白必看：7种图片学习全攻略嘿，生信小白们！𐟑‹ 欢迎来到生信世界，今天我们来聊聊那些让你眼花缭乱的图片学习。准备好了吗？Let's go! 火山图（Volcano Plot）𐟌‹ 火山图可是转录组研究的好帮手，常用于芯片和测序等组学检测技术的结果展示。它不仅能用于基因组，还能用于蛋白质组和代谢组等统计数据。通过颜色对比，你可以直观地看到不同样本中基因或RNA的表达差异，判断组间或个体间基因表达倾向的差异。热图（Heat Map）𐟔劧ƒ�𞦘露€种直观的可视化方法，用于分析实验数据的分布情况。它通过鲜明对比的颜色展示各种基因或RNA在不同样本中的表达，让你一眼就能看出多样本多个基因的全局表达量变化。此外，热图还能呈现多样本多基因表达量的聚类关系，帮助你理解样本间的聚类关系。 PCA图（Principle Component Analysis）𐟌 PCA图，也就是主成分分析，是降维的代表。它通过少数几个综合指标（主成分）来还原数据的本质特征。简单来说，就是把一堆复杂的指标简化成几个简单的成分，让你更方便地理解数据。韦恩图（Venn Diagram）𐟔„ 韦恩图主要用于集合的可视化。每个椭圆代表一个比较组合中的差异基因，椭圆重叠区域的数字表示多个比较组合之间的共有差异基因个数，未重叠区域则表示各比较组合特有的差异基因个数。它多用于比较2到3个比较组合。 Upset Plot𐟓Š 当数据集太多时，韦恩图就有点不够用了，这时候就需要用到Upset Plot图。它左下方的条图显示数据集及其包含的元素，右下方的数据集代表它所涉及的数据集，上方的条图则代表下方点阵图涉及到的数据集中交集包含的元素的个数。是不是有点绕？但没关系，多看几次就明白了。气泡图（Bubble Chart）𐟎ˆ 气泡图通过颜色标尺表示q值或p值，代表富集显著程度。气泡的大小表示基因数量多少，纵轴代表GO（细胞组分、分子功能、生物过程）或KEGG通路的不同类别，横轴代表富集程度。简单来说，就是让你一眼就能看出哪些基因在哪些通路上富集得最显著。弦图（Chord Diagram）𐟎𖊥𜦥›𞦘露€种表示实体之间相互关系的图形方法。连接圆上任意两点的线段叫做弦，弦就代表着关联关系。它在“多类别+复杂关系”的情况下非常有用，能有效降低视觉复杂度。想象一下，一堆复杂的关联关系通过弦图一目了然，是不是很酷？好了，今天的生信图片学习就到这里啦！希望这些内容能帮到你，让你在生信的道路上越走越远。加油！𐟒ꀀ

8k网络药理学教程免费分享，快来领取！大家好，今天我要和大家分享一份价值8k的网络药理学教程，真的是医学科研大佬们的结晶啊！经过一番努力，我终于学完了这些内容，现在整理出来分享给大家，绝对的白嫖福利哦！网络药理学教程概览 𐟓š 首先，这个教程包括了三个部分的详细内容：网络药理学做图软件、网络药理学相关文献以及一系列的网络药理学讲座。具体来说：网络药理学做图软件（3个）这些软件可以帮助你更好地进行网络药理学的可视化操作。网络药理学系列讲座这个部分包含了多个讲座，从基础到进阶，适合不同层次的研究人员。网络药理学相关文献这些文献都是最新的研究成果，可以帮你了解最新的研究动态。详细内容展示 𐟓– 接下来，我会详细介绍一下教程中的一些关键内容： KEGG富集分析.mp4 - 344.19MB GO功能富集分析.mp4 - 285.56MB 基因名字转换成基因id的脚本 - 182.36MB 药物调控网络.mp4 - 332.46MB cytoscape输入文件准备.mp4 - 179.45MB 蛋白互作PP网络构建.mp4 - 290.22MB 多个化合物处理.mp4 - 266.3MB TCMSP中药网络药理学资料 𐟌🊊此外，教程中还特别提到了TCMSP中药网络药理学资料，这部分内容非常适合中药研究者。具体包括： KEGG通路富集分析（走脚本） - 223.09MB GO功能富集分析（走脚本） - 237.3MB symbol转换为基因id（走脚本） - 136.98MB PPI网络核心基因（走脚本） - 181.73MB PPI网络构建 - 238.77MB 中药网络药理学可视化 - 304.1MB 总结 𐟓 这份教程真的是涵盖了网络药理学的方方面面，从基础到进阶，从软件到实践，内容非常丰富。希望这份教程能对大家有所帮助，赶紧下载学习吧！如果有任何问题，欢迎在评论区留言，我会尽力解答。祝大家科研顺利！

转录组代谢组联，揭秘代谢转录组和代谢组的联合分析主要分为两个关键部分：寻找共同的KEGG通路和功能富集：通过将差异基因和差异代谢物在KEGG数据库上进行共同富集分析，可以找出那些在特定通路中同时发生变化的基因和代谢物。相关性关联分析：计算差异基因和差异代谢物的相关性，并构建相关性网络。这样可以找出那些对代谢物变化起关键作用的基因，并确定关键的调控通路。这种联合分析方法可以帮助我们更全面地理解细胞代谢的复杂网络，揭示基因表达与代谢物变化之间的内在联系。#spss统计分析

转录组+代谢组，解锁生命之谜在生物学研究中，转录组和代谢组是两种强大的高通量技术，它们各自有着独特的优势和局限性。转录组研究主要关注基因表达的变化，而代谢组则更能直接反映生命活动的状态。将这两者结合起来，我们或许能更深入地理解生命的复杂机制。 𐟔 转录组与代谢组的联合分析，主要分为两个方向： 1️⃣ 寻找共同的KEGG通路和功能富集：通过对比差异基因和差异代谢物在KEGG数据库上的共同富集情况，我们可以找到那些关键的作用基因和代谢物。 2️⃣ 相关性分析：计算差异基因和差异代谢物的相关性，构建相关性网络。这样，我们就能找出那些对代谢物变化有关键影响的基因，并确定关键的调控通路。 𐟒ᠨ🙧獨”合分析的方法，不仅能弥补单一组学研究的局限性，还能在代谢通路上更好地解释转录调控机制。无论是科研工作者还是对生物学感兴趣的朋友，这种分析方法都为我们提供了一个全新的视角来探索生命的奥秘。

GEO数据库生信分析全攻略 GEO数据库生信分析是一种强大的工具，可以帮助我们理解生物数据。以下是详细步骤：差异表达分析 𐟓Š 通过先进的算法，我们可以找到在不同条件下表达水平有显著差异的基因。表达矩阵整理 𐟓ˆ 将数据集的探针ID进行转换，合并去批次，整理成表达矩阵。火山图和热图绘制 𐟔加基于limma分析或counts分析，绘制火山图和热图，直观展示差异表达情况。富集分析 𐟌 进行GSEA、ssGSEA、GSVA等富集分析，揭示基因的生物学功能。 GO和KEGG通路分析 𐟛䯸通过GO和KEGG通路分析，了解基因在细胞通路中的位置和作用。免疫浸润和转录因子分析 𐟧ꊠ 研究免疫细胞的浸润情况和转录因子的表达模式。网络突变分析 𐟌 利用WGCNA方法构建基因表达网络，进行网络突变分析。 CNV分析 𐟔 检测基因组的拷贝数变异，了解基因组结构的变化。聚类分析 𐟓ˆ 通过聚类分析，将表达模式相似的基因或样本聚在一起。敏感性分析 𐟧ꊠ 评估不同条件下的敏感性，了解实验结果的可靠性。多种数据库支持 𐟌 支持多种公共数据库，包括TCGA、ICGC、GEO、UCSC等，确保分析的全面性和准确性。生信作图 𐟎芠提供高质量的科研作图，帮助您直观展示分析结果。结果解读及解惑 𐟤” 提供详细的分析报告，帮助您理解复杂的生信数据。指导专业解读 𐟑袀⚕️ 对mRNAsi、C50和干性指数等先进指标提供专业解读。生信分析医学留学生咨询 𐟌 为医学留学生提供生物信息学咨询，指导生信分析和SCI写作。孟德尔随机化辅导 𐟧슠 提供孟德尔随机化定题、TWAS、SMR、PWAS、COLOC、PPIMR等分析服务。线性和非线性MR分析 𐟓ˆ 进行线性和非线性孟德尔随机化分析，了解基因与疾病的关系。暴露疾病、睡眠神经方向研究 𐟌쯸 研究环境暴露与疾病的关系，以及睡眠和神经系统的相关研究。肿瘤甲基化影响 𐟒Š 探索肿瘤中甲基化对基因表达的影响。通过这些步骤，我们可以更深入地理解生物数据，为科学研究提供有力支持。

网络药理学资料大放送，药理学必备！终于有大佬整理出了网络药理学的详细资料，赶紧分享给大家，不用白嫖！ 𐟓Š 网络药理学做图软件（3个）【网络药理学】相关文献【网络药理学】系列一（共11讲）【网络药理学】系列三（共15讲）【网络药理学】系列二（共14讲） 𐟓‚ 网络药理学资料（zip文件） KEGG富集分析.mp4 GO功能富集分析.mp4 基因名字转换成基因id（脚本安装）药物调控网络.mp4 Cytoscape输入文件准备.mp4 蛋白互作PP网络构建.mp4 多个化合物处理.mp4 𐟌🠔CMSP中药网络药理学资料 TCMSP中药网络药理学资料.zip KEGG通路富集分析（走脚本） GO功能富集分析（走脚本） symbol转换为基因id（走脚本） PPI网络核心基因（走脚本） PP网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 𐟔 详细内容 14. KEGG通路富集分析（走脚本） 13. GO功能富集分析（走脚本） 12. symbol转换为基因id（走脚本） 11. PPI网络核心基因（走脚本） 10. PPI网络构建 09. 中药网络药理学可视化 08. Cytoscape输入文件准备（走脚本） 07. 药物靶点和疾病靶点交集（走脚本）这些资料涵盖了网络药理学的各个方面，从基础到进阶，适合各个层次的药理学爱好者。赶紧下载学习吧！𐟓š

8k元网络药理学教程免费分享这些资料是医学科研大佬们精心整理的，经过一番努力终于学完了，现在分享给大家，绝对免费哦！网络药理学教程概览 𐟓š 网络药理学教程用不到了，分享给大家，拿走不谢！网络药理学系列一（共11讲） 𐟓– KEGG富集分析.mp4 GO功能富集分析.mp4 基因名字转换成基因id（脚本安装）药物调控网络.mp4 Cytoscape输入文件准备.mp4 蛋白互作PP网络构建.mp4 多个化合物处理.mp4 网络药理学系列二（共14讲） 𐟓– KEGG通路富集分析（走脚本） GO功能富集分析（走脚本） Symbol转换为基因id（走脚本） PPI网络核心基因（走脚本） PPI网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 网络药理学系列三（共15讲） 𐟓– KEGG通路富集分析（走脚本） GO功能富集分析（走脚本） Symbol转换为基因id（走脚本） PPI网络核心基因（走脚本） PPI网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 额外资料 𐟓 TCMSP中药网络药理学资料.zip KEGG通路富集分析（走脚本） GO功能富集分析（走脚本） Symbol转换为基因id（走脚本） PPI网络核心基因（走脚本） PPI网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 Cytoscape输入文件准备（走脚本）药物靶点和疾病靶点交集（走脚本）总结 𐟓 这些教程涵盖了网络药理学的多个方面，从基础到进阶，适合各个层次的科研人员。希望这些资料对大家有所帮助！

专栏内容推荐

当前用户设备UA：Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)