r语言安装前沿信息_r语言安装包(2024年11月实时热点)
R语言入门指南:从安装到进阶 R语言安装与配置 从CRAN网站下载R,并安装RStudio作为集成开发环境。 R语言基础 R使用`<-`或`=`进行赋值,用`#`注释,语句末尾不需要分号。 变量名可以包含字母、数字、点和下划线,但不能以数字开头。 ⠥즕樿算和函数 R支持常见的数学运算符和函数。 젩运算符和比较运算符 常用的逻辑运算符有`&`(与)、`|`(或)、`!`(非);比较运算符有`==`、`!=`、`<`、`>`等。 数据类型 R的基本数据类型包括数值型、字符型、逻辑型、复数型和因子型。 数据结构:向量 向量是R中最基本的数据结构,可以包含多个相同类型的元素。 数据结构:矩阵 矩阵是二维数组,包含相同类型的数据。 数据结构:数组 数组是多维的数据结构。 数据结构:列表 列表可以包含不同类型的元素。 数据结构:数据框 数据框是最常用的数据结构,类似于Excel表格。 索引和切片操作 使用[]进行索引和切片操作。 控制结构:if-else语句 用于条件执行。 控制结构:for循环 用于重复执行。 控制结构:while循环 当条件为真时重复执行。 控制结构:repeat循环 无限重复直到遇到break。 函数定义和使用 使用function()关键字定义函数。 作用域和环境 R使用词法作用域,函数可以访问其定义环境中的变量。
R语言数据预处理指南:轻松搞定数据清洗 在R语言中,dplyr是一个强大的数据处理包,它提供了一系列直观的函数来操作和分析数据。作为tidyverse集合的一部分,dplyr旨在使数据分析变得简单而优雅。要使用dplyr,首先需要安装tidyverse包(上一节课已经讲过如何安装,复习一下)。 管道符号 %>%:简化代码,将一个函数的输出作为下一个函数的输入。 砭utate():在数据框中添加新列或修改现有列。 select():选择数据框中的特定列。 ✏️ rename():更改数据框中的列名。 filter():根据条件筛选数据。 summarise():对数据进行摘要,如计算均值、总和等。 堧roup_by():按照一个或多个列对数据进行分组。 arrange():按照一列或多列的值对数据进行排序。 left_join(), right_join(), inner_join():合并两个数据框,根据共有的列进行连接。 通过这些函数,你可以轻松地进行数据预处理,为进一步的数据分析和建模打下基础。
R语言数据可视化:从零开始到实战 本节内容包括: 𑧊𖥛𞠨Bar plot) 𞠨Histogram) 𞠨Density) 图 (Boxplot) 𞠨Dotchart) 𘥅祛𞠨corrgram) 驘𞠨plot.matrix) 了「章鱼_叔叔」的数据可视化部分,现在正在寻找一些网络资源进行专题学习。后续会优先补充章鱼叔叔的数据清洗进阶部分,因为发现有些图需要用到。 学习目录放在了最后一张图,会持续更新,希望学习的速度可以赶得上目录更新的速度。近期需要写作业,暂停几天R语言学习,但会把已经学的部分陆续更新上来。 当前学习进度: 部分: 安装及界面了解 数据类型、基本运算、数据结构 数据结构(以及Package的安装和载入) 数据清洗【基础】 条件语句和循环、制图基础、常用统计方法、自定义函数 𐦍﨧化: 通用基础指令(mtcars为例) 常用统计图 多图形的绘制 ggplot2相关知识及使用 𐦍 洗: R基础函数(50%) 使用R包dplyr和tidyr的筛选、整合等操作(未开始) 𐦍﨧化专题: 小提琴图 (Violin chart)
如何快速入门生物信息学?小白必看! 嘿,小白们!如果你对生物信息学感兴趣,但又不知道从哪里开始,那你来对地方了!作为一个过来人,我深知初入这个领域的迷茫和困惑。今天,我就来分享一些实用的小技巧,帮你快速入门生物信息学,甚至有可能发表SCI文章哦! 一、生信分析的基本框架 生物信息学其实就是一个对测序数据或者公共数据库的数据进行分析挖掘的过程。通过这些数据,你可以找到和疾病相关的基因、蛋白或者信号通路,为课题找找方向,甚至发表SCI文章。 数据库和软件学习 𛊊生信分析主要分为两部分:数据库和软件学习。数据库方面,你可以学习如何使用现有的生信可视化网站,进行预测检索或者一站式出图。常见的数据库有GEPIA、Cbioportal、Oncomine、KM-plotter和Timer等。 软件和编程方面,主要学习Cytoscape和GSEA这两个软件。编程语言方面,R语言是个不错的选择,特别适合医学生。你需要掌握基本的R语言语法规则、可视化作图、统计分析、数据清洗以及解决具体问题的能力。 从易到难,逐步复现分析 슊第二步是从易到难,对生信文章进行复现分析。不求完整复现,但求能一步步按正确的方法操作下来。在这个过程中,你肯定会遇到很多bug或者不理解的地方,这时候就要发挥网络平台和社群的力量了。 迁移应用分析 第四步是根据最新的研究热点,进行新的迁移应用分析。比如最近的新冠疫情,不同场景的再应用,也催生了不少相关的生信文章。还有多组学分析、泛癌分析、m6A甲基化分析、可变剪切、SNP分析等等。 个人经验分享 我自己已经发表了15篇SCI文章,累计影响因子90+,参与过三个国自然应用项目。曾经在美国斯坦福大学实验室工作过三年。最近空闲时间多,想带几个徒弟,教他们生信分析。全程手把手教学,小白也能学会!让你们零基础就能上手发SCI! 课程内容 第1节:文献及方案讲解 第2节:R语言安装、TCGA/GEO数据下载与处理 第3节:差异分析、Cox+Lasso的风险模型构建与验证 第4节:独立预后、临床特征相关性及免疫微环境分析 第5节:药物敏感性、富集分析 第6节:WGCNA分析、HPA数据库分析 第7节:单基因免疫微环境、GSEA分析 第8节:框架讲解 总结 生物信息学其实并没有你想象的那么难,只要你有兴趣和毅力,完全可以快速入门并发表自己的研究成果。希望这些小技巧能帮到你,祝你早日成为生物信息学的大佬!如果有任何问题或者需要进一步的指导,随时联系我哦!
栒语言查询包历史版本的方法 在R语言中,查询某个包的历史版本有两种主要方法: 方法一:使用groundhog包 首先,安装并加载groundhog包: ```R library(tidyverse) library(groundhog) ``` 然后,使用toc函数查看ggplot2包的历史版本和发布时间: ```R toc('ggplot2') ``` 最后,使用arrange函数按发布日期降序输出: ```R arrange(toc('ggplot2'), desc(Published)) ``` 方法二:Rdocumentation网站手动查询 另一种方法是手动访问Rdocumentation网站,查找特定包的所有历史版本和发布时间。例如,ggplot2包的历史版本可以在该网站上找到。 方法三:使用devtools包安装特定版本 如果你需要安装特定版本的历史包,可以使用devtools包。首先,安装并加载devtools包: ```R install.packages("devtools") library(devtools) ``` 然后,使用install_version函数安装特定版本的包,例如安装3.4.4版本的ggplot2: ```R install_version("ggplot2", version = '3.4.4') ``` 最后,你可以使用packageVersion函数验证安装的版本: ```R packageVersion("ggplot2") ``` 通过这两种方法,你可以轻松查询和安装R语言中特定包的历史版本。
栒语言安装组件小技巧 在macOS系统上安装R语言的组件?试试这个小妙招!首先,使用`install.packages("tidyverse")`命令来安装你需要的组件。如果你遇到安装包不齐的问题,可能是因为你的R版本或者系统版本较旧。 更新你的电脑系统和R版本,问题就迎刃而解啦! 记得在安装过程中保持网络连接稳定,以确保所有依赖包都能成功下载和安装。
R语言入门与进阶指南:《R语言实战》书评 学习任何新语言或工具,首先需要了解其整体框架,然后逐步添加细节。这本书是R语言学习的完美入门指南,涵盖了五个主要部分: 1️⃣ 入门指南:介绍R语言的安装、数据集的创建等基础操作。 2️⃣ 基本方法:涵盖基本图形绘制、统计分析等基础内容。 3️⃣ 中级方法:包括回归模型、方差分析、功效分析等中级内容。 4️⃣ 高级方法:介绍广义线性模型、主成分分析、聚类分析等高级技术。 5️⃣ 技能扩展:涵盖高级绘图、高级编程等扩展技能。 新手可以从第一部分和第二部分开始,逐步深入了解。这本书也可以作为工具书,随时查阅和参考!
RStudio安装指南:轻松掌握科研利器 嘿,大家好!今天我要和大家分享一个超级实用的工具——RStudio!作为一个医学生和科研小能手,我深知数据分析在科研中的重要性,而R语言就是那个让数据变得超级听话的小魔法棒! 不过,光有R语言还不够,我们还需要一个梦幻舞台——RStudio!RStudio就像是R语言的豪华版编辑器,让你的编程之旅变得更加顺畅。它有代码高亮、智能提示、调试工具,还有超多插件,简直就是编程界的瑞士军刀! 安装RStudio其实超级简单,我会在配图里一步步教你。跟着图中的小指南,你也能成为R语言的高手!为什么我要用RStudio呢?因为它让我的科研工作变得轻松又高效。我可以快速导入数据,用R语言的强大功能进行各种分析,然后生成美美的图表。 如果你对数据分析、编程或者是医学研究感兴趣,那就不要错过啦!快来关注我,一起在科研的道路上飞驰吧!记得点赞关注哦!下次见!
Windows安装R&RStudio 嘿,朋友们!如果你正在为安装R语言和RStudio而头疼,那你来对地方了!今天,我会一步一步教你如何在Windows系统上安装这两个强大的工具。让我们开始吧! 一、安装R语言 访问R官方网站: 首先,打开你的浏览器,前往CRAN(Comprehensive R Archive Network)官网。 点击“Download R”链接,选择一个离你最近的镜像站点。 下载R安装程序: 在镜像站点页面,找到“Download R for Windows”并点击。 下载最新的R安装程序,通常是一个.exe文件。 安装R语言: 双击下载的安装程序,按照提示一步步进行安装。 选择一个你喜欢的安装路径,默认路径通常是C:\Program Files\R。 安装过程中,你可以选择是否创建桌面快捷方式。 二、安装RStudio 寸 访问RStudio官方网站: 打开浏览器,前往RStudio官方网站。 选择“RStudio Desktop”选项卡,点击“Download”下载最新版本的RStudio安装程序(通常是一个.exe文件)。 安装RStudio: 双击下载的安装程序,按照提示进行安装。 选择一个你喜欢的安装路径,默认路径通常是C:\Program Files\RStudio。 安装过程中,你可以选择是否创建桌面快捷方式。 三、启动RStudio 启动RStudio: 双击桌面上的RStudio快捷方式,或者在开始菜单中找到RStudio并点击启动。 验证安装: 打开RStudio,你会看到一个包含多个面板的界面,包括源代码编辑器、控制台、工作区和文件浏览器等。 运行R代码: 在控制台中输入以下命令并按回车键,验证R是否正常工作:print("Hello, R!") 如果一切正常,控制台会输出Hello, R!。 四、安装常用包 报蒓tudio的控制台中输入以下命令,安装一些常用的R包: install.packages("tidyverse") install.packages("ggplot2") install.packages("dplyr") install.packages("readr") install.packages("stringr") 五、小结 好了,这就是如何在Windows上安装R语言和RStudio的详细指南。希望对你有所帮助!如果你有任何问题,欢迎在评论区留言,我会尽力帮你解答。祝你编程愉快!
构建进化树的过程 学习进度 1⃣️ 尝试了多种方法安装ggtree包,包括install.packages()和BioManager,但都未能成功。最终选择了源代码安装,速度较快。 2⃣️ 掌握了使用ggtree R包绘制简单进化树的技巧。 目前在用的资源[星R] 在R语言绘制进化树方面,我参考了某站up小明的数据分析笔记本,按照他的方法和代码进行操作。最初难以下载ggtree包,尝试了多种方法后,最终通过查询AI如何用源代码安装,成功解决了问题。最近在尝试使用AI解决问题,无论是课程预习还是学习R语言中遇到的代码问题,AI都能提供可行的解决方案。 AI应用体验 最近,我表妹咨询我关于AI PC的选择意见。不得不说,现在AI已经深入各行各业了。我在京东打字~笔记本换新季~中看到了像联想小新Pro16、华硕灵耀14这些不错的AI本。最终,我帮她挑选了小新,它内置的本地AI助手和一秒生图功能非常实用。 AI挑战大赛 目前,我还参加了英特尔AI挑战大赛。只要在红薯上发布自己与AI的故事和作品,并带上#酷睿Ultra校园神器标签,就可以参加。不仅可以欣赏到大佬们的创意AI作品,还有机会获得618元大奖!我已经提交了参赛作品,感兴趣的同学请注意截止时间,不要错过哦~
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